滅菌的物品必須徹底清洗干凈，注意不能用生理鹽水清洗，滅菌物品上不能有水滴或水份太多，以免造成環(huán)氧乙烷稀釋和水解。環(huán)氧乙烷幾乎可用于所有醫(yī)療用品的滅菌，但不適用于食品、液體、油脂類、滑石粉和動物飼料等的滅菌。適合于環(huán)氧乙烷滅菌的包裝材料有紙、復合透析紙、布、無紡布、通氣型硬質容器、聚乙烯等；不能用于環(huán)氧乙烷滅菌的包裝材料有金屬箔、聚氯乙烯、玻璃紙、尼龍、聚酯、聚偏二氯乙烯、不能通透的聚丙烯。改變包裝材料應作驗證，以保證被滅菌物品滅菌的可靠性。 

滅菌柜內裝載物品上下左右均應有空隙(滅菌物品不能接觸柜壁)，物品應放于金屬網狀籃筐內或金屬網架上；物品裝載量不應超過柜內總體積的80%。

滅菌處理：應按照環(huán)氧乙烷滅菌器生產廠家的操作使用說明書的規(guī)定執(zhí)行；根據滅菌物品種類、包裝、裝載量與方式不同，選擇合適的滅菌參數。

濃度、溫度和滅菌時間的關系: 在一定范圍內，溫度升高、濃度增加，可使滅菌時間縮短。在使用環(huán)氧乙烷滅菌時必須合理選擇溫度、濃度和時間參數。

控制滅菌環(huán)境的相對濕度和物品的含水量：細菌本身含水量和滅菌物品含水量，對環(huán)氧乙烷的滅菌效果均有顯著影響。一般情況下，以相對濕度在60%～80% 比較好。含水量太少，影響環(huán)氧乙烷的滲透和環(huán)氧乙烷的烷基化作用，降低其殺菌能力；含水量太多，環(huán)氧乙烷被稀釋和水解，也影響滅菌效果。為了達到理想的濕度水平，滅菌物必須先預濕，一般要求滅菌物放在50%相對濕度的環(huán)境條件下至少2h以上；可用加濕裝置保證柜室內理想的濕度水平。

注意菌體外保護物對滅菌效果的影響：菌體表面含有的有機物越多，越難殺滅；有機物不僅可影響環(huán)氧乙烷的穿透，而且可消耗部分環(huán)氧乙烷。在無機鹽或有機物晶體中的微生物，用環(huán)氧乙烷難以殺滅。因此進行環(huán)氧乙烷滅菌前，必須將物品上有機和無機污物充分清洗干凈，以保證滅菌成功。